La plan de suivi du milieu marin a imposé la réalisation d'un état de référence. 14 emplacements ont été définit et 9 font actuellement l'objet d'un suivi.
Les stations décrites correspondent au suivi et non à l'état de référence. Le choix des stations peut varié (conditions météorologiques, courant marin, zone portuaires avec trop de manœuvres...).
Suivi visant à analyser la bio-accumulation de métaux et de solvants dans les espèces bio-indicatrices, à savoir bivalves et algues brunes. 8 stations concernées à raison d'une campagne par an. Elle s'effectue en saison fraiche et dure trois mois.
la récolte d'espèces bio-accumulatrices se fait sur une zone de référence non contaminée. Les spécimens récoltés font le même poids et la même taille. Elles sont insérées dans des cages au niveau des stations à surveiller : on parle de transplantation.
Après trois mois d'immersion, les cages sont récupérées et les échantillons peuvent ensuite être préparés.